火车站建于1901年，是中东铁路时期的五等站，原名满沟站，解放后改名肇东站。据专家介绍，肇东站的建筑设计很独特，在现存的中东铁路沿线历史建筑有的一座。中东铁路初创时期的铁路沿线车站是按照等级来修建的，每种等级的建筑都不相同，作为五等站的满沟站站舍按理说不应该有如此规模和独特设计，肇东站的修建历史始终是一个未解之谜。

肇东站站舍建筑设计十分独特，卫生所、车务段和职工住宅等建筑上对称的木制雨搭，做工精美的俄式门窗、烟囱，跨线天桥立柱上清晰的俄文缩写字母，整座车站还都保留着原始的风貌，见证着百年历史。

哈尔滨滨市博物馆馆长杜赤表示，肇东站作为中东铁路的历史建筑具有较高的建筑艺术价值和历史文化价值，对研究我省历史、文化，发展旅游等方面都具有重要的意义。